Emploi Slovaquie
Titre du poste : PhD position in Agriculture and Landscape Management
Titre du poste : PhD position in Agriculture and Landscape Management
Entreprise :
Description du poste : Offer DescriptionAntifungal activity of selected essential oils in vitro, in situ, and in vivo conditions agaisnt phytopatogenic microscopic filamentous fungiSupervisor: prof. Ing. Miroslava Kačániová, PhD.Departament: Institute of HorticultureField of Study: Agriculture and Landscape ManagementStudy Program: HorticultureStudy Form: dailyThesis:The aim of the dissertation is to analyze ethnopharmacologically significant commercially produced plant essential oils from foreign sources that have not yet been studied in the available literature. The study will focus on the antifungal properties of essential oils and their impact on fruit and vegetable spoilage. All obtained essential oil samples will be stored in sealed and labeled test tubes at 4 °C before any chemical analysis or biological activity testing. Identification and quantification of individual phytochemical compounds in the essential oil samples will be performed using an Agilent Technologies gas chromatograph. The semi-quantitative composition of the samples will be determined using gas chromatography coupled with quadrupole mass spectrometry (GC-MS). A modified vapor diffusion method will be used to test the antifungal activity of essential oils. For the determination of the mycelial invasion distance (MID), only those essential oils that completely inhibit the growth of tested strains after 14 days of cultivation at a concentration of 500 μL/L (oil volume/air volume) will be used. The stepwise dilution method will be employed to reduce the concentration of essential oils. In the second phase, the research will focus on testing the antifungal activity of essential oils against selected strains of phytopathogenic microscopic filamentous fungi on a food model (fruits and vegetables). Based on the findings from in vitro and in situ methods, selected essential oils will be tested in vivo on specific crops infected with phytopathogenic microscopic filamentous fungi. Finally, the dissertation will also focus on analyzing allergens in essential oil sources using molecular biological methods. The candidate will be required to handle a high workload during the experiments, demonstrate skills in microbiological laboratory work, possess fluency in scientific English, have knowledge of statistical methods, exhibit strong communication skills, be proficient in graphic software, and have experience publishing in scientific journals.Justification:The dissertation is based on current expert findings published in scientific journals, many of which it innovates and translates into practice. The significance of this research lies in both its practical and theoretical contributions. The originality of the project goals primarily lies in obtaining novel insights into the biologically active components of ethnopharmacologically significant plant essential oils produced abroad, using new methodological approaches and state-of-the-art instrumental techniques not yet described in the available literature. Another important aspect of the research is the analysis of allergens in essential oil samples, which has not been previously studied in foreign contexts. This issue has received little attention so far, and such parameters have not been tested on a global scale. Additionally, the unique combination of methodological procedures and analyses will reveal relationships between various factors (chemical, antifungal).Funding:VEGA 1/0059/24 – Chemical properties and biological activity (in vitro, in vivo, and in situ) of plant volatile compounds, their main components, and inclusion systems. KEGA 023SPU-4/2024 – Visual aids in the form of animated outputs and videos for developing students’ practical skills in the courses « Bacterial Diseases of Plants » and « Microbial Biotechnologies in Horticulture. »Antifungálna aktivita vybraných rastlinných silíc v in vitro, in situ a in vivo podmienkach proti fytopatogénnym mikroskopickým vláknitým hubámŠkoliteľ: prof. Ing. Miroslava Kačániová, PhD.Pracovisko: Ústav záhradníctvaŠtudijný odbor: Poľnohospodárstvo a krajinárstvoŠtudijný program: ZáhradníctvoForma štúdia: dennáTézy:Cieľom dizertačnej práce bude analyzovať etnofarmakologicky významné komerčne vyrábané rastlinné silice zo zahraničných zdrojov, ktoré doposiaľ neboli sledované v dostupnej literatúre. V práci budú sledované antifungálne vlastnosti rastlinných silíc a ich vplyv na kazenie ovocia a zeleniny. Všetky získané vzorky rastlinných silíc budú uchovávané v uzavretých a označených skúmavkách pri teplote 4 °C (pred každou chemickou analýzou alebo testovaním biologických aktivít). Identifikácia a kvantifikácia jednotlivých fytochemických zlúčenín zo vzoriek rastlinných silíc sa uskutočnia pomocou plynového chromatografu Agilent Technologies. Semikvantitatívne zloženie vzoriek z rastlinných silíc bude stanovené pomocou plynovej chromatografie s kvadrupólovou hmotnostnou spektrometriou (GC-MS). Na testovanie antifungálnej aktivity rastlinných silíc bude použitá modifikovaná plynná difúzna metóda. Pre stanovenie MID (minimálnej inhibičnej dávky) sa použijú iba tie silice, ktoré úplne inhibujú rast testovaných kmeňov po 14 dňoch kultivácie pri koncentrácii 500 μl.l-1 (objem silice/objem vzduchu). Na znižovanie koncentrácie silíc sa použije metóda klesajúcej koncentrácie silíc. V druhej fáze sa zameriame na testovanie antifungálnej aktivity rastlinných silíc na rast vybraných kmeňov fytopatogénnych mikroskopických vláknitých húb na modelovej potravine (ovocie, zelenina). Na základe zistených výsledkov metódami in vitro a in situ, sa budú rastlinné silice testovať in vivo na vybraných konkrétnych plodinách infikovaných s fytopatogénnymi mikroskopickými vláknitými hubami. A nakoniec bude dizertačná práca zameraná na alergény v zdrojoch silíc molekulárno-biologickými metódami. Od uchádzača sa budú vyžadovať vysoké pracovné zaťaženie počas pokusov, zručnosti v mikrobiologickom laboratóriu, plynulá znalosť vedeckej angličtiny, poznatky zo štatistických metód, komunikatívnosť, zvládanie grafických programov a skúsenosti v publikovaní vo vedeckých periodikách.Zdôvodnenie:Dizertačná práca vychádza z aktuálnych výsledkov prác expertov publikovaných vo vedeckých časopisoch, ktoré v mnohých aspektoch inovuje a uvádza do praxe. Riešenie predkladaného projektu je dôležité z hľadiska praktickej aj teoretickej významnosti. Originálnosť cieľov riešenia projektu spočíva predovšetkým v získaní originálnych poznatkov o biologicky účinných zložkách jednotlivých etnofarmakologicky významných rastlinných silíc vyrobených v zahraničí s využitím nových metodických postupov a najmodernejšej prístrojovej techniky, ktoré ešte neboli doposiaľ opísané v dostupnej literatúre. Ďalším významným poznatkom bude analyzovanie alergénov vo vzorkách rastlinných silíc, ktoré neboli doposiaľ sledované v zahraničných podmienkach. Tejto problematike sa na doteraz venovalo málo pozornosti a sledované ukazovatele v svetových podmienkach v takomto meradle zatiaľ nebolo testované. Rovnako unikátna je aplikácia kombinácie metodických postupov prípadne analýz a odhalenie vzťahov medzi jednotlivými faktormi (chemické, antifungálnej).Finančné krytie: VEGA 1/0059/24 Chemické vlastnosti a biologická aktivita (in vitro, in vivo a in situ) rastlinných prchavých zmesí, ich hlavných zložiek a inklúznych systémov, KEGA 023SPU-4/2024 Vizuálna pomôcka v podobe animovaných výstupov a videí pre rozvoj praktických zručností študentov na cvičeniach z predmetov Bakteriálne ochorenia rastlín a Mikrobiálne biotechnológie v záhradníctve.Where to apply WebsiteRequirementsResearch Field Agricultural sciences Education Level Master Degree or equivalentLanguages ENGLISH Level GoodLanguages SLOVAK Level ExcellentAdditional InformationWork Location(s)Number of offers available 1 Company/Institute Slovak University of Agriculture in Nitra Country Slovakia GeofieldContact State/ProvinceSlovakia CityNitra WebsiteStreetTrieda Andreja Hlinku 2 Postal Code949 76STATUS: EXPIREDShare this page
Salaire attendu :
Localisation : Nitra, Nitrianský kraj
Date du poste : Wed, 30 Apr 2025 03:06:49 GMT
Postulez dès maintenant !