Présentation du poste de Postdoctoral Researcher en Algorithmes et Biologie Computationnelle
Universität de Helsinki
L’Université de Helsinki recherche un Postdoctoral Researcher en Algorithmes et Biologie Computationnelle, avec un début prévu en septembre 2025 ou selon accord. Ce poste, en contrat à temps plein d’une durée maximale de 2 ans, est situé au sein du département d’informatique.
Description du poste
Le candidat retenu travaillera dans le cadre du projet de recherche intitulé Structural correctness in metagenomics assembly, financé par le Conseil de recherche de Finlande, au sein de l’équipe de la Maîtresse de conférences Leena Salmela. Ce projet s’inscrit dans le laboratoire d’Algorithmic Bioinformatics, qui se concentre sur le développement de modèles, d’algorithmes et de structures de données pour les données de séquençage à haut débit, en mettant l’accent sur l’assemblage génomique.
La quantité de données de séquençage a considérablement augmenté au cours de la dernière décennie. Pour analyser ces données de manière efficace, un assemblage précis en génomes est nécessaire. Cependant, les outils actuels ne garantissent pas l’exactitude, ce qui entrave l’estimation fiable des analyses en aval. Le projet vise à développer des modèles novateurs pour évaluer la précision de l’assemblage de génomes et de métagénomes, ainsi que des algorithmes pour le calcul de ces estimations.
Le Postdoctoral Researcher aura pour responsabilités de :
- *Avancer la recherche en collaboration avec l’équipe du projet.*
- *Publier ses résultats dans des revues scientifiques internationales et à des conférences.*
- *Superviser les étudiants participant au projet.*
Une part de l’activité peut inclure des activités d’enseignement, pour un maximum de 5 à 10 % du temps de travail annuel.
Exigences et critères d’éligibilité
Le candidat doit disposer d’un doctorat en informatique ou en bioinformatique (ou dans des domaines connexes), avec une spécialisation en sciences computationnelles et une expérience en développement d’algorithmes. Une expérience dans le traitement de données de séquençage à haut débit est souhaitable. Une maîtrise des compétences écrites et orales en anglais est nécessaire. Il est également essentiel d’avoir un intérêt marqué pour l’application des découvertes algorithmiques à la biologie et une capacité à mener des recherches de manière autonome.
Salaire et avantages
Le salaire prévu pour le chercheur postdoctoral se situe entre 3800 et 4150 euros par mois, en fonction des qualifications et de l’expérience du candidat. L’Université de Helsinki offre une gamme complète de services à ses employés, y compris des soins de santé au travail, un accès à des installations sportives de qualité, ainsi que de nombreuses possibilités de développement professionnel.
Qualité de vie en Finlande
La Finlande, membre de l’UE, bénéficie d’un système éducatif de haute qualité, avec une scolarité gratuite (y compris en anglais). Les prestations familiales et les soins de santé généreux, couplés à la reconnaissance de la Finlande comme le pays le plus heureux du monde, font de cette destination un choix attractif. La région d’Helsinki dispose d’une expertise scientifique de premier plan, avec un réseau de collaboration solide et des services de soutien efficaces.
Candidatures et informations supplémentaires
Les candidats sont invités à soumettre leur candidature en anglais, incluant :
- *Un CV, accompagné d’une liste de publications.*
- *Une description de l’expérience de recherche (1-2 pages).*
- *Les noms et contacts de deux référents.*
- *Une copie du certificat de doctorat.*
Les candidatures doivent être soumises via le système de recrutement de l’Université de Helsinki, à l’adresse indiquée dans l’annonce, avant le 15 août 2025 (à 23h59 UTC + 3).
Pour toute question relative au projet ou au poste, veuillez contacter Leena Salmela. Pour obtenir des informations sur le groupe de recherche et ses publications, une page dédiée est mise à disposition. Pour toute assistance liée au système de recrutement, les services des ressources humaines sont disponibles.
Le département d’informatique de l’Université de Helsinki est reconnu comme un acteur majeur dans le domaine de l’enseignement et de la recherche en informatique, avec un large éventail de compétences allant de l’intelligence artificielle à la bioinformatique, garantissant ainsi une collaboration internationale enrichissante.
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📅 Date de publication de l’offre : Tue, 01 Jul 2025 00:02:54 GMT
🏢 Entreprise : UNIVERSITY OF HELSINKI
📍 Lieu : Helsinki
💼 Intitulé du poste : Postdoctoral Researcher in Algorithms and Computational Biology
💶 Rémunération proposée :
📝 Description du poste : Department of Computer Science of Faculty of Science invites applications for aPOSTDOCTORAL RESEARCHER IN ALGORITHMS AND COMPUTATIONAL BIOLOGYstarting from September 2025, or as agreed. The Postdoctoral Researcher will be a full-time contract for the maximum duration of 2 years.Position descriptionThe successful candidate will work within the research project “Structural correctness in metagenomics assembly” funded by the Research Council of Finland in the research group of University Lecturer Leena Salmela. We develop models, algorithms and data structures for high throughput sequencing data with a main emphasis on genome assembly. The research group is part of the Algorithmic Bioinformatics lab at University of Helsinki.The amount of sequencing data has increased enormously during the last decade. To analyze the data efficiently, it needs to be assembled to genomes or represented in a compact manner. However, current tools for assembly and compaction of sequencing data produce sequences with no estimate of their correctness which severely hampers accurate estimation of the correctness of downstream analysis. In this project we will develop novel models for estimating the correctness of genome and metagenome assembly and algorithms and data structures for computing such correctness estimates.The postdoctoral researcher is expected to: * advance the research project together with the project team
- publish your findings in international scientific journals and international scientific conferences
- help in supervising student(s) working in the project
Your work may also include teaching duties (at most 5-10% of annual working time).Requirements and eligibility criteriaThe Postdoctoral Researcher should have a PhD degree in computer science or bioinformatics (or related fields) with an emphasis on computational sciences and have experience in algorithm development. Experience in processing of high-throughput sequencing data is an advantage. Excellent written and oral communication skills in English are needed. You should have a strong interest and motivation for applying algorithmic discoveries in biology and possess the ability to carry out independent research.Salary and benefitsThe starting salary of the doctoral researcher will be ca. 3800-4150 euros/month, depending on the appointees’ qualifications and experience. The University of Helsinki offers comprehensive services to its employees, including occupational health care, support in access to high quality sports facilities, and vast opportunities for professional development.Finland is a member of EU, has high quality free schooling (also in English), generous family benefits and healthcare, and was recently ranked as the happiest country in the world. Finland and the Helsinki region possess top expertise in sciences in terms of a vibrant talent pool, leading research, strong support services and functioning collaboration networks. For more information about working at the University of Helsinki and living in Finland, please see .A diverse and equitable study and work culture is important to us. That is why we do our best to promote an inclusive university community. We encourage all qualified applicants from diverse backgrounds to apply for our positions.How to applyPlease submit your application, which includes the following documents in English:
- A curriculum vitae including a list of publications.
- Description of research experience (1-2 pages)
- Names and contact information of two referees, who are willing to provide reference letters upon request.
- Copy of a PhD degree certificate
External applicants, please submit your application through the University of Helsinki´s recruitment system via the Apply Now button.Applicants who have a helsinki.fi username and a valid employment/grant/visitor contract at the University of Helsinki are requested to submit their application via the Employee login button.The deadline for submitting applications is August 15th, 2025 (at 23:59 UTC + 3).More information?For questions project and position related questions, please contact
- University Lecturer Leena Salmela
For more information on the research group and publications, seeIf you need support with the recruitment system, please contact HR Services ( ).***is a leading unit in Finland in its area and responsible for the teaching and research in computer science at the University of Helsinki. The main research fields at the department are artificial intelligence, big data frameworks, bioinformatics, data analysis, data science, discrete and machine learning algorithms, distributed, intelligent, and interactive systems, networks, security, and software and database systems. The department has extensive international collaboration with companies and universities. Within teaching, the department’s professors and staff are in charge of the Bachelor’s, Master’s, and Doctoral Programmes in Computer Science, as well as the separate Master’s Programme in Data Science, in which other departments also participate.
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