Postdoctoral Researcher in Multimodal Machine Learning for Precision Cancer Medicine
Emploi en Finlande : Chercheur Postdoctoral en Apprentissage Machine Multimodal pour la Médecine de Précision en Oncologie
Présentation du poste
Entreprise : Université d’Helsinki
Titre du poste : Postdoctoral Researcher in Multimodal Machine Learning for Precision Cancer Medicine
L’Université d’Helsinki, reconnue pour son engagement en faveur de l’innovation en recherche, propose un poste de chercheur postdoctoral axé sur l’apprentissage machine multimodal appliqué à la médecine de précision en oncologie. Ce rôle s’inscrit dans un contexte de collaboration interdisciplinaire, où l’objectif principal est de développer des modèles d’apprentissage machine à partir de données pan-cancer multiomiques.
Objectifs du projet
Le projet vise à créer des modèles prédictifs utilisant un large éventail de données issues de diverses sources biologiques et cliniques. Les chercheurs bénéficieront d’une infrastructure avancée, y compris l’accès à un superordinateur, pour traiter des données réelles en collaboration avec des experts en médecine de précision. L’ambition est de transformer les pratiques oncologiques grâce à des analyses de données à grande échelle.
Responsabilités clés
Les principales tâches associées à ce poste incluent :
- Conception et mise en œuvre : Développer et évaluer des modèles d’apprentissage machine pour des ensembles de données complexes intégrant génomique, transcriptomique, épigénomique et imagerie.
- Collaboration : Travailler étroitement avec des expérimentateurs et des cliniciens pour mieux appréhender et modéliser les processus biologiques et les phénotypes de maladies.
- Mentorat : Encadrer des étudiants et assister les membres de l’équipe dans la planification expérimentale et l’interprétation des résultats.
- Contributions scientifiques : Participer à la rédaction d’articles scientifiques, à des présentations en conférences et à des demandes de financement.
- Culture scientifique ouverte : S’engager dans des démarches d’open science et de partage de code.
Compétences et qualifications requises
Les candidats doivent posséder :
- Diplôme : Un doctorat (PhD ou équivalent) en informatique, science des données, statistiques, bioinformatique ou un domaine connexe.
- Publications : Un solide dossier de publications dans les domaines de l’apprentissage machine, bioinformatique ou biologie computationnelle.
- Compétences techniques : Maîtrise de Python et expérience dans des environnements HPC basés sur Linux ou sur des plateformes de cloud.
- Expérience avec les frameworks : Familiarité avec des frameworks d’apprentissage profond comme PyTorch ou TensorFlow; connaissance de la fusion de données multimodales est un atout.
- Langues : Une excellente maîtrise de l’anglais, tant à l’oral qu’à l’écrit.
Le groupe de recherche
Le groupe de recherche MLBioMed se situe à l’intersection de l’intelligence artificielle et de la médecine de précision. L’équipe s’engage à développer des méthodes d’apprentissage machine adaptées aux données biologiques multimodales et collabore étroitement avec des consortiums nationaux et internationaux, incluant iCAN Digital Precision Cancer Medicine et FinnGen.
Conditions de contrat et rémunération
Ce poste est un contrat à durée déterminée de trois ans, avec une période d’essai de six mois. La rémunération est basée sur le système salarial de l’Université d’Helsinki, avec une fourchette initiale de 3 600 à 4 200 euros par mois, selon le profil du candidat et ses performances. Des avantages tels qu’une pension standard finlandaise et des soins de santé au travail sont inclus.
Processus de candidature
Les candidatures sont à soumettre au plus tard le 31 août 2025. Le processus peut être prolongé jusqu’à ce qu’une décision de recrutement soit prise. Les candidats doivent inclure :
- Un CV de deux pages
- Une liste de publications
- Une déclaration de motivation d’une page
- Les coordonnées d’une référence
Les candidatures doivent être déposées via le système de recrutement électronique de l’Université d’Helsinki. Pour toute question supplémentaire, veuillez contacter le Dr Esa Pitkänen.
Engagement pour la diversité et l’inclusion
L’Université d’Helsinki promeut un environnement de travail inclusif et diversifié. Tous les candidats qualifiés, quelles que soient leurs origines, sont encouragés à postuler.
Inspirons-nous ensemble pour bâtir un monde meilleur !
📅 Date de publication de l’offre : Fri, 27 Jun 2025 22:30:32 GMT
🏢 Entreprise : UNIVERSITY OF HELSINKI
📍 Lieu : Helsinki
💼 Intitulé du poste : Postdoctoral Researcher in Multimodal Machine Learning for Precision Cancer Medicine
💶 Rémunération proposée :
📝 Description du poste : Postdoctoral Researcher in Multimodal Machine Learning for Precision Cancer MedicineThe at the , University of Helsinki, is currently seeking a highly-motivated postdoctoral researcher to join our interdisciplinary team.Project overviewThis project aims to develop machine learning models for large-scale pan-cancer multiomics data. We build on our previous work (e.g., ; ), developing the new models on the supercomputer and evaluating them on real-world data (e.g., in ) in collaboration with precision cancer medicine experts. We strive to revolutionize cancer care through the power of massive data and machine learning!Key responsibilities
- Design, implement and benchmark deep machine learning models for large-scale cancer datasets that include genomics, transcriptomics, epigenomics and imaging data
- Collaborate closely with experimentalists and clinical partners to understand and model biological processes and disease phenotypes
- Supervise and mentor students, and assist other team members in experiment planning, data processing and interpretation of results
- Contribute to writing scientific articles, conference presentations and grant applications
- Take part in open science and code sharing
Skills, expertise and qualifications
- A doctoral degree (PhD or equivalent) in computer science, data science, statistics, bioinformatics, or a related discipline
- A strong publication record in machine learning, computer science, bioinformatics, or computational biology
- Proficiency in Python and experience working in Linux-based HPC environments or cloud computing platforms
- Proven experience with deep learning frameworks such as PyTorch or TensorFlow, and familiarity with multimodal data fusion is highly desirable
- Familiarity with the AMD ROCm software stack is considered an asset
- Ability to work independently, as well as collaboratively in interdisciplinary and international research teams
- Excellent command of spoken and written English
Research groupMLBioMed is an interdisciplinary research group at the intersection of artificial intelligence and precision medicine. We develop machine learning methods tailored for high-dimensional, multimodal biological data, with applications ranging from single-cell genomics to real-world clinical datasets. We are active contributors to open science. We work closely with national and international consortia, such as iCAN Digital Precision Cancer Medicine, FinnGen and Genomics England to apply our models in clinically meaningful contexts.Contract and salaryThe position is for a fixed term of three years. A trial period of six months will be applied. Salary will depend on the applicant’s skills, knowledge, and abilities, and is based on the University of Helsinki salary system. The starting salary will be ca. 3,600-4,200 euros/month, depending on the appointee’s qualifications and experience and including a salary component based on personal performance. Standard Finnish pension benefits and occupational health care are provided for university employees.Apply at latest by August 31st, 2025. The call may be extended until a hiring decision is made.How to apply: The application should include (i) two-page CV, (ii) list of publications, (iii) a one-page motivation statement for applying for this position, and (iv) contact information of at least one reference (name, relation to candidate, e-mail and telephone number) who has agreed to provide a written statement on behalf of the applicant.To apply, please submit the application through the University of Helsinki electronic recruitment system by clicking on Apply for job. Internal applicants (i.e., current employees of the University of Helsinki) please submit your applications through SAP Fiori .For further information on the position, please contact Dr. Esa Pitkänen ( ).A diverse and equitable study and work culture is important to us. That is why we do our best to promote an inclusive university community. We encourage all qualified applicants from diverse backgrounds to apply for our positions..JOIN US TO BUILD A BETTER WORLD – TOGETHER!#HelsinkiUniCareersThe Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM) is an international research unit focusing on human genomics and personalized medicine at the Helsinki Institute of Life Science (HiLIFE) of the University of Helsinki – a leading Nordic university with a strong commitment to life science research. As part of Academic Medical Center Helsinki in Meilahti campus FIMM collaborates locally with the Faculty of Medicine, Helsinki University Hospital and National Institute for Health and Welfare. FIMM is part of the Nordic EMBL Partnership for Molecular Medicine, composed of the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) and the centres for molecular medicine in Norway, Sweden and Denmark, and the EU-LIFE Community.
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