Consultant – Soil Microbiology for Antimicrobial Resistance in Aquaculture
Offre d’Emploi: Consultant – Microbiologie du Sol pour la Résistance aux Antimicrobiens en Aquaculture
Entreprise: International Atomic Energy Agency (IAEA)
Description du poste:
Le Département des Sciences Nucléaires et des Applications de l’IAEA met en œuvre le Programme Principal 2, « Techniques Nucléaires pour le Développement et la Protection de l’Environnement ». Ce programme vise à renforcer la capacité des États Membres à répondre aux besoins fondamentaux des humains et à évaluer et gérer les environnements marins et terrestres à travers des techniques nucléaires et isotopiques, favorisant ainsi des programmes de développement durable.
La *Joint FAO/IAEA Centre des Techniques Nucléaires en Agriculture* collabore avec les États Membres pour améliorer la sécurité alimentaire et promouvoir l’agriculture durable. Le centre est composé de plusieurs sections et laboratoires axés sur divers domaines, y compris la gestion des sols et des eaux, et la sécurité alimentaire.
Objectif Principal:
Cette consultance au sein du laboratoire de gestion des sols et des eaux vise à développer un protocole préliminaire pour étudier le comportement des antimicrobiens dans les sédiments des étangs d’aquaculture et évaluer leur utilisation sécurisée en agriculture. Ce projet répond aux défis critiques liés à la persistance des antimicrobiens dans les sédiments, aux risques environnementaux et aux implications pour la sécurité alimentaire.
Portée et Résultats Attendus:
Le consultant intégrera des méthodes microbiologiques et moléculaires avec une analyse de traçage isotopique pour étudier la dégradation des antibiotiques et les changements microbiens dans des conditions contrôlées. Les résultats comprendront un cadre expérimental et des directives basées sur des preuves pour la réutilisation sécurisée des sédiments d’aquaculture à des fins agricoles.
- Réalisation de trois expériences microcosmiques avec des sédiments incubés avec des sulfonamides.
- Suivi des communautés microbiennes lors de la transition d’un environnement anaérobie vers un environnement aérobie.
- Utilisation de séquençage de nouvelle génération du 16S rRNA pour comparer les espèces dominantes dans différents environnements.
Compétences et Aptitudes Requises:
Un solide bagage en gestion des sols et des ressources en eau est essentiel. Le candidat devra démontrer une expertise en techniques microbiologiques et en analyse, particulièrement en ce qui concerne les tests de résistance antimicrobienne.
Qualifications et Expérience:
- Diplôme universitaire (baccalauréat) en Science du Sol ou dans un domaine connexe.
- Minimum de deux ans d’expérience dans des approches isotopiques stables et des techniques microbiologiques spécialisées.
- Expérience dans l’isolement de l’ADN, le séquençage de prochaine génération et le profilage taxonomique.
Une bonne maîtrise de l’anglais à l’oral et à l’écrit est un atout, ainsi que des connaissances dans d’autres langues officielles de l’IAEA.
Rémunération:
Le tarif journalier pour cette consultance peut atteindre 150 €, selon les qualifications et l’expérience. Des allocations journalières et le remboursement des frais de voyage seront offerts si un déplacement est nécessaire. La couverture santé et le fonds de pension relèvent de la responsabilité du consultant.
Salaire attendu: à discuter
Localisation: Seibersdorf, Niederösterreich
Date du poste: Dimanche, 15 Juin 2025
📅 Date de publication de l’offre : Sun, 15 Jun 2025 04:39:20 GMT
🏢 Entreprise : International Atomic Energy Agency
📍 Lieu : Seibersdorf, Niederösterreich
💼 Intitulé du poste : Consultant – Soil Microbiology for Antimicrobial Resistance in Aquaculture
💶 Rémunération proposée :
📝 Description du poste : Organizational SettingThe Department of Nuclear Sciences and Applications implements the IAEA’s Major Programme 2, « Nuclear Techniques for Development and Environmental Protection ». This Major Programme comprises individual programmes on food and agriculture, human health, water resources, environment and radiation technologies. These programmes are supported by laboratories in Seibersdorf, Monaco and Vienna. The Major Programme’s objective is to enhance the capacity of Member States to meet basic human needs and to assess and manage the marine and terrestrial environments through the use of nuclear and isotopic techniques in sustainable development programmes.The Joint FAO/IAEA Centre of Nuclear Techniques in Food and Agriculture assists Member States of the Food and Agriculture Organization of the United Nations (FAO) and the IAEA in using nuclear techniques and related technologies to improve food security, alleviate poverty and promote sustainable agriculture. The Joint Centre consists of five Sections, each with an associated laboratory (located in Seibersdorf, 45 km south-east of Vienna), in the areas of: animal production and health; plant breeding and genetics; insect pest control; soil and water management and crop nutrition; and food safety and control.The Soil and Water Management and Crop Nutrition Section and Laboratory assist Member States in developing improved soil and water management practices for sustainable intensification of agricultural production systems, the conservation of natural resources and the effective use of external inputs through applied and adaptive research and development activities, technology transfer and capacity buildingMain PurposeThis consultancy at the Soil and Water Management and Crop Nutrition Laboratory aims to develop a preliminary
protocol for studying the behaviour of antimicrobials in aquaculture pond sediments and assessing their safe use in
agriculture. It supports PUI project ‘Integrated Strategies for Managing Antimicrobial Resistance in Western and Central
African Aquaculture’. The project addresses key challenges such as antimicrobial persistence in sediments, their
environmental risks, and implications for food safety when reused as fertilizers. It also examines microbial dynamics
and the effects of transitioning from anaerobic to aerobic conditions.Scope and Expected Outcomes
The consultancy integrates isotopic tracing (e.g. Cavity Ring Down Spectrscopy analysis) with microbiological and
molecular methods (165 rRNA and PLFA) to study antibiotic degradation and microbial changes under controlled
conditions. Outcomes include an experimental framework and evidence-based guidelines for the safe agricultural reuse
of aquaculture sediments. These results will inform Member States on sustainable practices and contribute to the IAEA
project Assessment of Soil Contaminants in Agricultural LandsFunctions / Key Results Expected
- Carry out three microcosm experiments with sediments incubated with sulfonamides (including fully carbon-
13 labelled sulfamethoxazole, SMX) using Laser Cavity Ring-Down Spectroscopy (CRDS)and SMX extraction to
evaluate the rate of SMX degradation. * Incubate sediment microbial communities under controlled environmental conditions (pH, temperature,dissolved oxygen) to monitor microbial growth during the transition from anaerobic to aerobic conditions. * Perform 16S rRNA next generation sequencing and SIP-PLFAanalyses to compare the dominant species inaerobic versus anaerobic environments.Knowledge, Skills and Abilities
- Soil and Water Management and Crop Nutrition
Qualifications and Experience
- University degree (bachelor) in Soil Science or related field.
- Minimum two years’ experience in stable isotope approaches and specialized soil microbiological techniques.
- Experience in soil microbiological techniques and analysis, including microbial inoculation and culture
methods, antimicrobial resistance (AMR) testing, DNA isolation, next-generation sequencing, and taxonomic
profiling. * Experience in the use of stable carbon isotope techniques to assess the fate of AMR in agricultural soils,including incubation experiments using Laser Cavity Ring-Down Spectroscopy (CRDS)analysis. * Good knowledge of oral and written command of English. Knowledge of other official IAEA languages (Arabic, Chinese, French, Russian, Spanish) an asset.RemunerationThe remuneration for this consultancy is a daily fee of up to a maximum of € 150, based on qualifications and experience. In case duty travel is required within the assignment, a daily subsistence allowance (DSA) and travel costs are provided. Health coverage and pension fund are the responsibility of the incumbent.
🔎 Offre d’emploi vérifiée et enrichie selon la ligne éditoriale de l’Association Artia13 : éthique, inclusion, transparence et vigilance contre les annonces trompeuses.
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